Magang Riset Tugas Akhir -
S1/D4, S2 dan S3 -
Bioinformatika

Nama Kelompok Riset/Fungsi Kegiatan : Bioinformatika

Deskripsi Kegiatan Kelompok Riset/Fungsi Kegiatan : Kelompok Riset Bioinformatika berfokus pada pemodelan komputasi biologi, analisis multi-omics, pengolahan data medis, dan perancangan pipeline analisis dengan memanfaatkan HPC. Pendekatan yang dilakukan berdasarkan algoritma yang dikembangkan di bidang ilmu informatika/ilmu komputer yang diturunkan dari teori di bidang ilmu matematika. Pemahaman dasar tentang sistem biologi dan kemampuan analisis menggunakan pendekatan komputasi diperlukan untuk memodelkan data serta menafsirkan hasilnya.

Tipe Magang : Magang Riset Tugas Akhir

Topik Kegiatan/Riset : 
TOPIK 1
Topik :
1. Bioinformatics (Omics analysis-based, MSA, high-throughput data)
2. Computational biology (Cellular-based Systems Biology, Network Biology, Mathematical for Cancer modeling)
3. Data-driven Artificial Intelligence and High-Performance Computing in Computational Biology & Bioinformatics
Ruang Lingkup Topik Kegiatan/Riset : 
1. Bioinformatics (Omics analysis-based, MSA, high-throughput data)
2. Data-driven Artificial Intelligence and High-Performance Computing in Computational Biology & Bioinformatics
3. LLM for biomedical informatics
Pembimbing: Dr. Achmad Fatchuttamam Abka, M.Kom. (achm034@brin.go.id)
Jenjang Pendidikan: S1 / D4
Program Studi/Jurusan Pendidikan : Teknik Informatika, Computer Science, Teknik Komputer, Teknik Fisika/Biofisika, Biologi, Matematika biologi
Kuota : 1 peserta

TOPIK 2
Topik : Pengembangan Model untuk Multiple Sequence Alignment, Pengembangan LLM untuk Bioinformatika.
Ruang Lingkup Topik Kegiatan/Riset : 
- Studi literatur terkait machine learning untuk dataset genomik,
- Pengumpulan dan pengolahan dataset untuk machine learning,
- Melakukan pemrograman untuk training, test, dan evaluasi model,
- Melakukan eksperimen dan analisis model,
- Penyusunan publikasi ilmiah dan laporan penelitian,
- Pengembangan aplikasi terkait hasil penelitian.
Pembimbing: Dr. Achmad Fatchuttamam Abka, M.Kom. (achm034@brin.go.id)
Jenjang Pendidikan: S1 / D4
Program Studi/Jurusan Pendidikan : Ilmu Komputer, Teknik Informatika, Sains Data, Sistem Informasi, Kecerdasan Artifisial, Bioinformatika, Biologi Komputasi, Bioteknologi, Teknik Biomedis.
Kuota : 2 peserta

TOPIK 3
Topik : 
1. Bioinformatics (Omics analysis-based, high-throughput data)
2. Biomedical informatics
3. Software development platform for cohort study
Ruang Lingkup Topik Kegiatan/Riset : 
A. Biomedical informatics (knowledge-based systems biology and medical informatics)
B. Bioinformatics (Omics analysis-based, high-throughput data)
Pembimbing: Dr. Arida Ferti Syafiandini, M.Kom. (arid002@brin.go.id)
Jenjang Pendidikan: S1 / D4
Program Studi/Jurusan Pendidikan : Teknik Informatika, Computer Science, Bioinformatika/Computational biology,Teknik Komputer, Biofisika, Teknik Fisika, Biologi, Biostatistika/Statistika
Kuota : 2 peserta

TOPIK 4
Topik : Sistem Informasi Anotasi Teks Biomedis
Ruang Lingkup Topik Kegiatan/Riset : Mengembangkan sistem informasi untuk anotasi teks biomedis
Pembimbing: Dr. Arida Ferti Syafiandini, M.Kom. (arid002@brin.go.id)
Jenjang Pendidikan: S1 / D4
Program Studi/Jurusan Pendidikan : Teknik Informatika; Sistem Informasi; Ilmu Komputer
Kuota : 1 peserta

TOPIK 5
Topik : Analisis data omics untuk tanaman, hewan, dan bakteri
Ruang Lingkup Topik Kegiatan/Riset : Melakukan analisis data omics untuk tanaman, hewan, dan bakteri
Pembimbing: Imam Civi Cartealy, MPhil (imam012@brin.go.id)
Jenjang Pendidikan: S1 / D4
Program Studi/Jurusan Pendidikan : Biologi/ilmi komputer/statistik
Kuota : 1 peserta

TOPIK 6
Topik : Radiomics dan Machine Learning pada Citra Medis
Ruang Lingkup Topik Kegiatan/Riset : Penerapan Radiomics dalam Berbagai Modalitas Pencitraan sebagai Decision Support System, Penerapan Machine Learning pada Citra Medis
Pembimbing: Julfa Muhammad Amda, S.ST., M.Si (julf001@brin.go.id)
Jenjang Pendidikan: S1 / D4
Program Studi/Jurusan Pendidikan : Fisika Medis, Informatika, Teknik Biomedik
Kuota : 2 peserta

TOPIK 7
Topik : Radiomics dan machine learning untuk analisis data medis
Ruang Lingkup Topik Kegiatan/Riset : Pengolahan dan analisis data radiomics. Pengembangan model machine learning untuk diagnosis dan prediksi penyakit. Ekstraksi fitur dari citra medis. Pengembangan sistem pendukung keputusan berbasis AI.
Pembimbing: Julfa Muhammad Amda, S.ST., M.Si (julf001@brin.go.id)
Jenjang Pendidikan: S1 / D4
Program Studi/Jurusan Pendidikan : Teknik/Ilmu komputer, Ilmu fisika, Fisika medis, teknik informatika,
Kuota : 2 peserta

TOPIK 8
Topik :
1. Bioinformatics (multi-Omics analysis-based, MSA, high-throughput data)
2. Computational biology (Cellular-based Systems Biology, Network Biology, Mathematical Cancer modeling, boolean network model)
3. Data-driven Artificial Intelligence, pipeline development, and  High-Performance Computing in Computational Biology, Bioinformatics, Biomedical informatics
Ruang Lingkup Topik Kegiatan/Riset : 
A. Bioinformatics (Omics analysis-based, high-throughput data)
a. Multi-Omics analysis in Precision Oncology
b. Immunoinformatics for FMDV vaccine development
c. Pipeline development for whole genome sequencing (WGS) and in silico vaccine (development tools)
B. Computational biology (Cellular-based Systems Biology, Network Biology, Mathematical for Cancer modeling)
a. Cancer dynamics mechanisms through A Boolean network model (network science)
b. Systems biology in herbal science for hypertension
c. Data-driven & Artificial Intelligence in Computational Biology & Bioinformatics
Pembimbing: Maulida Mazaya, Ph.D. (maulida.mazaya@brin.go.id)
Jenjang Pendidikan: S1 / D4, S2 dan S3
Program Studi/Jurusan Pendidikan : Bioinformatics, Computational biology, Systems Biology, Teknik informatika, Computer Science, Ilmu Komputer, Biofisika, Fisika, Matematika biologi, Komputasi Graf, Network Science, Biologi, Teknik Kimia
Kuota S1/D4 : 2 peserta
Kuota S2 : 2 peserta
Kuota S3 : 2 peserta

Lokasi Magang BRIN : KST Cibinong (Soekarno)

Syarat Pengajuan:

• Surat Pernyataan
• File Dukung Lainnya
• Surat Pengantar
• File Proposal
• Daftar Riwayat Hidup
• File Kartu BPJS (Jaminan Kesehatan)

Nama Berkas	Ukuran Berkas
Berkas SOP/Formulir/Ajuan Layanan	0.24 MB
Template Surat Pernyataan	0.02 MB
Template File Dukung Lainnya	0 MB
Template Surat Pengantar	0.01 MB
Template File Proposal	0.06 MB
Template Daftar Riwayat Hidup	0.02 MB
Template File Kartu BPJS (Jaminan Kesehatan)	0 MB